Программу для дизайна коротких фрагментов ДНК, необходимых для диагностики онкологических заболеваний создали в передовой инженерной школе новосибирского государственного университета. Она позволяет врачам самостоятельно формировать нуклеотидные последовательности, необходимые для постановки диагноза конкретному пациенту, передает телеканал «Якутия 24» со ссылкой на ТАСС.
«В ПИШ НГУ была разработана программа „Олигодизайнер“, которая позволяет осуществлять дизайн олигонуклеотидов для областей генома, которые интересны врачам в целях диагностики. В результате работы программы формируется готовый файл с нуклеотидными последовательностями, который передается в специализированную организацию для синтеза олигонуклеотидов», — приводятся слова руководителя центра компетенций ПИШ НГУ «Биотехнологии и микрофлюидика» Ольги Науменко.
Она отметила, на сегодня в России необходимые для NGS-секвенирования компоненты не синтезируют — реагенты для работы заказывались за рубежом, а разработок дизайна этих компонентов в России не производили, добавила Ольга.
Руководителя центра компетенций также рассказала, что молекулярно-генетические методы в диагностике онкологических заболеваний используют для выявления нарушений в генах, являющихся причиной развития заболеваний. Результаты диагностики необходимы для правильной постановки диагноза и выбора оптимальной стратегии лечения и использования таргетной терапии.
Такой подход позволит избежать назначения неэффективной и дорогостоящей терапии. Метод NGS-секвенирования позволяет исследовать одновременно множество областей генома, нарушения в которых могут быть связаны с развитием онкологических заболеваний.
Сообщается, что программа будет доступна врачам для выбора актуальных реагентов при диагностике и выборе терапии пациентов. При этом, работа в «Олигодизайнере» не требует специальных навыков в области биоинформатики и программирования.
Кроме всего, в процессе использования программа будет обучаться на данных, полученных в ходе секвенирования. Это даст возможность создавать усовершенствованные версии олигонуклеотидов для повышения точности диагностики.
